Σε ένα πολύ μακρινό μέλλον, μια παραψυχική ορμόνη που ανακαλύφθηκε στον ανθρώπινο εγκέφαλο, η οποία χάρισε στους ανθρώπους εξω-αισθητικές δυνάμεις, αλλάζοντας τον κόσμο όπως τον γνωρίζουμε.

Καθώς η ανθρωπότητα εισερχόταν σε αυτή τη νέα εποχή, οι παρανοϊκοί μεταλλαγμένοι, γνωστοί ως «Others» άρχισαν να κατεβαίνουν από τον ουρανό με δίψα για ανθρώπινα μυαλά. Ιδιαίτερα ανθεκτικοί στις συμβατικές μεθόδους επίθεσης, χρειάστηκαν ακραία μέτρα για την καταπολέμηση της συντριπτικής απειλής και τη διατήρηση της ανθρωπότητας. Εκείνοι που διαθέτουν εξω-αισθητικές ικανότητες, γνωστοί ως Ψιονικοί, ήταν η ευκαιρία για να καταπολεμιστεί η επίθεση από ψηλά. Μέχρι σήμερα, οι Ψιονικοί έχουν εντοπιστεί για τα ταλέντα τους και έχουν στρατολογηθεί στην Other Suppression Force (OSF), την τελευταία γραμμή άμυνας της ανθρωπότητας.

Πάρτε το ρόλο του Yuito Sumeragi, ενός νεοσύλλεκτου στην OSF που έχει σκοπό να γίνει ένας κορυφαίος ψιονικός σαν εκείνον που τον έσωσε όταν ήταν παιδί. Οπλισμένοι με το ταλέντο της τηλεκίνησης, εξερευνήστε τη φουτουριστική πόλη της New Himuka και ανακαλύψτε τα μυστήρια ενός Brain Punk μέλλοντος εγκλωβισμένου ανάμεσα στην τεχνολογία και τις παραψυχικές ικανότητες στο SCARLET NEXUS.